Neurologické oddělení má ve strakonické nemocnici dlouhou historii. Vzniklo v padesátých letech minulého století a v současné době ho vede primář Pavel Houška. Neurologie má ve Strakonicích svoji ambulantní část, rozsáhlý komplex ambulantních specializovaných poraden i část lůžkovou, která má v současné době 23 lůžek. Pacienti tohoto oddělení se rekrutují zejména z lidí, kteří mají bolavá záda, vyhřezlé plotýnky, poruchy mozku, případně neurodegenerativní onemocnění typu Alzheimerovy nebo Parkin
