Fakultní nemocnice využily dvě miliardy od státu určené na opravy areálů a pavilónů především na nákup zdravotnické techniky a různých strojů a zařízení. Některé z nakoupených přístrojů přitom pak nemocnice využívaly omezeně právě proto, že předtím nerealizovaly plánované stavby. S touto kritikou přišel v pondělní tiskové zprávě Nejvyšší kontrolní úřad (NKÚ).